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菌落，是指由單個微生物細胞或一堆同種細胞在適宜固體培養(yǎng)基表面或內(nèi)部生長繁殖到一定程度，形成以母細胞為中心的一團肉眼可見的、有一定形態(tài)、構(gòu)造等特征的子細胞集團。各種微生物在一定條件下形成的菌落特征，如大小、形狀、邊緣、表面、質(zhì)地、顏色等，具有一定的穩(wěn)定性，是衡量菌種純度、辨認和鑒定菌種的重要依據(jù)。菌落特征與微生物的菌體形態(tài)結(jié)構(gòu)特征密切相關(guān)。例如，細菌、酵母菌不形成菌絲，其菌落僅生長在固體培養(yǎng)基表面，與培養(yǎng)基結(jié)合不緊密，可用接種工具將其全部挑起；而放線菌、霉菌的菌體大多分化為營養(yǎng)菌絲與繁殖菌絲，營養(yǎng)菌絲深入培養(yǎng)基中吸取營養(yǎng)，具有與培養(yǎng)基結(jié)合較緊，不易挑起等特征。

通常是細菌在固體培養(yǎng)基上（內(nèi)）生長發(fā)育，形成以母細胞為中心的一團肉眼可見的、有一定形態(tài)、構(gòu)造等特征的子細胞的集團，稱之為菌落。